Genómica Evolutiva 2021
Perfilado de sección
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Bienvenidos al curso de Genómica Evolutiva
Este curso pretende brindar al estudiante un enfoque conceptual de genómica evolutiva. En particular, se busca hacer énfasis en los mecanismos y fuerzas evolutivas que operan a las diversas escalas de la organización genómica y, como contracara, qué aspectos del funcionamiento genómico son relevantes a la hora de entender sus procesos evolutivos.
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Estructura y duración:
90 hs, 15 semanas (6hs por semana)
Modalidad:
Virtual
Días y horarios:
Teóricos: Martes de 15hs a 17hs
Prácticos: Jueves y viernes de 10hs a 12hs
Comienzo 2021:
23 de marzo (clase de presentación del curso)
Comienzo práctico 26 de marzo
Link de Zoom para todas las clases:
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https://us02web.zoom.us/j/89385479212?pwd= UFB2S1pjTkk0S0lFbDlncHpXN01Zdz 09
Meeting ID: 893 8547 9212
Passcode: GenEV -
Este foro es para despejar preguntas relacionadas al examen
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Clase introductoria del curso
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1.a - Tamaño genómico
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1.b - Mecanismos de transmisión de la información genética (más allá de la segregación mendeliana)
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1.c - Estrategias de compartimentalización genómica
Desde virus y operones hasta transcription factories, isocoros, TADs y LADs -
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1.d - Isocoros
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1.e - Uso de codones sinónimos
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2.a. Repetición y evolución genómica
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2.b. Elementos móviles
Clasificación y evolución -
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2.c. Elementos móviles
Su contribución a plasticidad genómica -
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2.d. La repetición en las zonas codificantes: familias multigénicas, nacimiento y muerte de genes
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2.e. Evolución del HIV
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3a. Endosimbiosis primarias y origen de los eucariotas
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3b. Evolución de genomas citoplasmáticos
clase plástidoshttps://drive.google.com/file/d/1IB18CGmigLmIUfKUPrOaes1wMTy2EbBC/view?ts=6100cd2c -
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El link para bajar la máquina virtual es https://drive.google.com/file/
d/ .1Lq5vx9Alt6JfyETUGfngtZr1usJUy LTe/view?usp=sharing Son unos 13 Gb, luego de bajarlo hay que descomprimirlo.
Les dejamos un video explicativo de cómo instalar la máquina virtual.
También queda disponible el video del inicio de la clase del 26/3 donde hablamos de la máquina virtual.
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1- Pre-procesamiento de secuencias
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2- Ensamblaje
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4 - Predicción y anotación de ensamblaje
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