Buenas tardes,
Tengo una duda sobre la tarea que nos mandasteis para hacer para el próximo viernes. Una vez que he corrido el programa canu con los comandos que pone en el documento de la práctica me aparecen 3 carpetas, una para cada uno de las secuencias. Hay archivos fasta y fastq que puedo ver con el comando fastq pero, aparte de eso no sé cómo seguir con la tarea.
Creo que Velvet no tengo que utilizarlo porque he entendido que ese programa se utiliza para lecturas cortas. Entonces no se si tengo que continuar de la misma manera (cortando el genoma y luego usar velvet) o no he entendido como funciona canu.
Dentro de cada carpeta tengo archivos que supongo que es lo que me ha generado canu, pero ninguno me suena y no se cómo trabajar con ellos.
Gracias