Buenas,

Yo diría que todas las tecnologías tienen precios muy competiticos, la más barata siendo nanopore. De forma general, cuanto más grande es la máquina más bajo es el precio por base, pero necesitas secuenciar más.

Te cuento los precios de Nanopore que son los que conozco mejor. En la escala más baja, el precio por Gb de output en nanopore (usando el flow cell Flonge o el MinIon) oscila entre 20 y 90 dolares. Con un Gb podés secuenciar con buena profundidad facilmente diez bacterias, posiblemente varias más, dependiendo del tamaño del genoma y la profundidad que necesites. A eso hay que sumarle el costo de preparación de librería, lo que serían unos 100 dolares más al costo total. Eso da un costo inferior a 20 dolares por bacteria. En escalas mayores el costo por Gb de Nanopore de secuenciación + preparación de librerías es aprox. 100 dolares, y llega a un plateau por el costo de las librerías, que estabiliza el precio final. EL costo de la secuenciación en sí llega a ser inferior a 5 dolares por Gb.

EL costo de PacBio (Sequel I) es un poco superior, unos 200 dolares por Gb, incluyendo secuenciación y preparación de librería.

El costo de secuenciación de Illumina y 454 por Gb tiene una media de 100 dolares por Gb. A eso hay que sumarle el costo de la preparación de librerías, que no tengo claro cuál es. 

Todo esto es costo por Gb y nos permite aproximar el costo por bacteria, pero hay que tener en cuenta que el costo si querés secuenciar una única bacteria es bastante mayor, por eso Fernando hablaba de que ya no tiene sentido secuenciar una bacteria. 

Igual quedamos a la espera de la respuesta de Fernando a ver si nos cuenta a qué tecnología se refería él.

Saludos